本館隸屬校史室。籌設於民國76年（1987年），民國77年（1988年）2月4日祝聖啟用。民國80年（1991年）12月為配合天主教文物館陳列整體化，進行重新規劃及隔間工程，民國81年（1984年）2月嶄新面貌開放參觀；民國88年(1999年)再次進行改館工程，11月18日祝聖啟用。 位於行政大樓，佔地20餘坪，主要呈現創校以來校史資料紀錄，並且以歷史文件、精神標幟、人物影像、主體建築及現況分區展示，來彰顯輔仁的教育理念。

　　校史館共分6區，「對話」、「歲月」、「翼風」、「網絡」、「精神」及「偶拾」：「對話篇」，以圖片的形式重現昔日的規模，並和今日做對照；「歲月篇」則是本校簡史及文物的展示；「翼風篇」呈現輔仁大學從北平到台北建築的特色風格；「網絡篇」利用樹狀圖說明輔仁從復校後系所成長擴充的情形；「精神篇」則展示校徽、校旗以及校歌的理念和意義；「偶拾篇」，為特色展示區，包含傑出校友等名人致贈的紀念品。

北平輔仁畢業戒指 （此畢業戒指僅1948年前畢業典禮有）	1972.6.29 蔣宋美齡夫人蒞臨主持董事會議之座椅